אגודת ניצן השתתפה בפרויקט ישראל 2000 לחברה ישראלית טובה יותר. הפרויקט כולו נערך ביוזמת איגוד הבנקים – ארגון הגג המאגד את הבנקים בישראל, קרן כהנוב – קרן פילנתרופית הפועלת בישראל ובקנדה ומשקיעה בפרויקטים חברתיים, "רשת" – זכיינית ערוץ 2 וגיתם פורטר נובלי.
רבקה קדרון ז"ל הייתה היוזמת להקמת המרכז הארצי ללקויות למידה. היא האמינה שטיפול מונע, לאחר איתור הלקות ואפיונה, הינו תנאי ראשון לקידומו של התלמיד המתקשה, ולכן פעלה ליצירת שיתוף פעולה בין הגורמים השונים להקמת המרכז.
אגודת ניצן ציינה 50 שנה להיווסדה באירוע חגיגי ומרגש עם מקימיה ומתנדביה הבולטים, אשר מלווים אותה באהבה ובנתינה שנים רבות. והעניקה אות יקיר ניצן למתנדבי האגודה לאורך השנים אשר תרמו תרומה משמעותית לאגודה ולפועלה.
