עמותת ניצן תהיה איגוד ארצי מרכזי למתן עזרה, טיפול וחינוך משלים של אוכלוסיית לקויי הלמידה, בכל מקום בישראל על מנת להבטיח את שיקומם, עתידם ומעמדם ולהבטיח להם איכות חיים נאותה, במגמה להגיע לכל ילד לקוי למידה בארץ" (מתוך תקנון האגודה משנת 2001). בחזונה ראתה האגודה, אז כמו היום, את לקויי הלמידה משתלבים בכל מעגלי החיים, וממצים את הפוטנציאל הגלום בהם.

על מנת להגשים את חזונה הלכה למעשה פעלה האגודה וממשיכה בפעולותיה גם בהווה, ומקדמת את המודעות והידע בקרב הורים, מורים ואנשי מקצוע וכל זאת, על מנת שנושא לקויי הלמידה לא ירד מסדר היום הלאומי בקרב מקבלי ההחלטות והרשויות המוסמכות.

אגודת ניצן שוקדת על מנת לשמור ולקדם את מעמדם של לקויי הלמידה במדינת ישראל וזכותם לשוויון הזדמנויות ולפיכך, תמשיך האגודה גם בשנים הבאות לפתח סטנדרטים לאבחון ולטיפול עבור קהיליית המאבחנים והמטפלים בארץ וזאת, על בסיס הידע והניסיון אשר נצבר במהלך השנים המשמש גם כיום, אבן שואבת לכל העוסקים בתחום.